Программное обеспечение для компьютеризованной морфометрии Bitplane Imaris.
Размещение: василеостровская площадка
Статус: эксплуатация в режиме тестирования
Основной модуль BP-IM71-SF, включая:
1. BP-IMARIS-75 Imaris 7.5
Программный пакет для обработки 3D и 4D изображений, полученных с использованием световых микроскопов различного класса. Позволяет визуализировать 3D и 4D наборы снимков с высокой скоростью рендеринга, формировать 3D изображения, работать с отдельными объектами на снимках и сохранять исходное изображение в файл сцены, содержащий результаты выделения объектов и обработки.
2. BP-IMP-75 Imaris Measurement Pro 7.5
Предоставляет пакет инструментов для расчета, отображения и экспорта статистики по объектам, выделенным на микроскопических снимках, включая расстояние между объектами в трёхмерном пространстве реконструкции, суммарную воксельную интенсивность объекта, объем, параметры формы и положения объектов. Включает опцию представления результатов выделения в интерактивном режиме и опцию экспорта данных в формате MS-Excel и др. Включает инструменты сортировки и классификации объектов, инструменты ручного выделения, в том числе 3D-объектов.
3. BP-IMTR-75 ImarisTrack 7.5
Предоставляет пакет инструментов для отслеживания перемещений объектов и частиц на временных сериях изображений, включая методы сегментации изображений, работающих как автоматически, так и полуавтоматически. Адаптирован для работы с «шумными» изображениями, а также с сериями, где объект теряет светимость на некоторых кадрах. Предусматривает возможность визуализации движений треков объектов (в 2D и в 3D) с отображением маршрутов или полей перемещений различными способами.
4. BP-IM-CO75 ImarisColoc 7.5
Предоставляет пакет инструментов, позволяющий рассчитывать степень колокализации изображений на разных каналах в 3D и 4D с возможностью автоматизированного выделение колокализованых вокселей на 2D гистограмме или на изображении, с представлением результата как в виде дополнительного канала на изображении, так в форме статистического отчета.
5. BP-IM-Tracer75 FilamentTracer 7.5
Предоставляет пакет инструментов для трейсинга волокон. Позволяет автоматически выделять и визуализовать волокнистые структуры с сохранением опцией ручного выделения, подсчитывать и экспортировать число ветвлений, общую длину волокон (или деревьев волокон) их толщину, с представлением результата в 3D.
6. BP-IMCell-71 ImarisCell 7.5
Предоставляет пакет инструментов, позволяющий выделять и анализировать клеточные компоненты с пошаговым выделением объектов.
7. BP-AA-60 AutoAligner 6.0
Предоставляет пакет инструментов для автоматического или ручного пространственного выравнивания цветных и монохромных серий 2D-изображений, с возможностью применения дальнейшего анализа с использованием других пакетов системы.
8. BPA-AQX210-G-CWF+U AutoQuant X v.2.1и AutoDeblur Gold CWF.
Программные пакеты для деконволюции изображений, полученных на широкопольных или конфокальных микроскопах (включая мультифотонные и с вращающимся диском) и создания изображений с высоким разрешением путем устранения внефокусного света, размытия, шума и других дефектов изображений на 2D и 3D снимках. Используется количественный алгоритм слепой деконволюции AutoQuant.
Дополнительно: сайт компании производителя
http://www.bitplane.com/
