Fluidigm BioMarkHD

fluidigm-biomark.jpg
Изображение с сайта www.fluidigm.com

     Fluidigm BioMarkHD – это высокочувствительная система для проведения ПЦР в реальном времени, основанная на жидкостных микрочипах, для одновременного проведения тысяч независимых реакций в нанообъемах (~10 нл). Система состоит из оборудования, программного обеспечения и микрочипов.

прибор может быть использован для:

  • высокопроцессивного анализа экспрессии генов
  • генотипирования 
  • профилирования экспрессии генов на уровне единичных клеток
  • количественной оценки числа копий молекул
  • приготовления фрагментных библиотек при секвенировании

Размещение: петергофская площадка

Статус: эксплуатация в режиме тестирования

Календарь занятости прибора

Основные технические характеристики

Параметр

Характеристика

Чувствительность

детекция вплоть до 1 молекулы

Производительность

от 2 304 до 36 960 индивидуальных ПЦР реакций за запуск прибора (2-3 часа), более 50 000 точек данных в день

Фильтры возбуждения сигнала, нм

475, 530, 575

Фильтры детекции сигнала, нм

525, 570, 630

Детекция

CCD камера

Источник излучения

LED

Температурный контроль

элементы Пельтье, диапазон 44°С-99°С
нагрев: >5°C/сек
охлаждение: >5°C/сек

Используемые чипы

48.48, 96.96 и 192.24 Dynamic Arrays
многоразовые FR48.48 и FR192.24 Dynamic Array 12.765
и 48. 770 Digital Arrays

Программное обеспечение

BioMark™ Data Collection Software

BioMark™ Real-Time PCR Analysis software

BioMark™ Genotyping Analysis software

BioMark™ Digital PCR Analysis software


В составе прибора имеются станции для работы с чипами Dynamic Arrays 48.48, 192.24,  Access Array 48.48 и Digital Array 48.770
Подробнее: ссылка на сайт производителя: www.fluidigm.com

Принцип работы

     В основе системы лежит жидкостной микрочип, состоящий из тысяч нанокамер и системы капилляров с управляемыми затворами. Нанокамеры расположены попарно, так что в каждой паре одна камера предназначена для реакционной смеси и одна для образца. Микрочип соединён каналами с лунками для нанесения реакционных смесей и образцов. Пользователь заполняет лунки для нанесения, после чего система распределяет реакционные смеси и образцы по нанокамерам. Далее происходит попарное смешивание образцов и реакционных смесей в камерах для реакционных смесей, после чего происходит термоциклирование и фиксация флуоресценции CCD-камерой. Система позволяет проводить до 9216 независимых реакций за один раз.
     При приготовлении фрагментных библиотек используются специальные микрочипы (Access Array), позволяющие производить выгрузку продуктов ПЦР реакции с использованием имеющийся в наличии станции.
     При проведении цифровая ПЦР (Digital PCR) ограниченное количество образцов (12) распределяется по большому количеству нанокамер, так что в каждую камеру попадает не более одной копии целевой ДНК. Количество нанокамер, в которых прошла реакция амплификации, отражает абсолютное количество искомых молекул в исходном образце.

Методики

В разработке

Требования к образцам

В разработке

Дополнительные аксессуары

В разработке




Смотрите также:

Смотрите также специализированную систему цифрового ПЦР (DD-PCR) BioRad QX-100